Funktionelle Genomik / Funktionelle Genomforschung - Einzelansicht

Das Modul besteht aus einer VL und einem zweiwöchigen Praktikum. Ergänzend wird eine fakultative Übung angeboten.

Der erfolgreiche Abschluss des Moduls ist eine Voraussetzung (neben anderen) für eine Bewerbung für eine Bachelorarbeit in der Abteilung Molekularbiologie.

Volesung: Termine siehe PULS Eintrag.

Praktikum: findet im Zwischensemester statt, 04.03.-15.03.2024 (für alle Gruppen parallel); es wird in 3 Gruppen mit je max. 6 TN durchgeführt

Übung: Die Übung ist integriert in das Praktikum.

Bitte melden Sie sich nur in einer der Gruppen an; je nach Anzahl der Anmeldungen werden wir zu Beginn des Semesters die Plätze vergeben und den Gruppen zuordnen. 

Jegliche Informationen, Terminabsprachen, mögliche Gruppeneinteilungen und Bereitstellung von Materialien zu den jeweiligen Themen erfolgen über den Moodle-Kurs "Funktionelle Genomik". Das Zugangs-Passwort erhalten eingeschriebene Studierende.

Es wird empfohlen, das Modul Molkualrbiologie II abgeschlossen zu haben.

Vorlesung:

Die Vorlesung wird in u.U. englischer Sprache gehalten

Inhalte:

1. Introduction, structure of genomes
2. DNA cloning
3. Genome editing by CRISPR-Cas9 and related technologies
4. Sanger sequencing and next generation sequencing
5. Regulation of transcription: Inducible expression systems (chemical and light induced), promoter and terminator engineering (mRNA stability)
6. Transcriptomics
7. Protein-DNA interactions. Reporter genes, promoter analysis, EMSA
8. Protein-RNA interactions
9. Protein-protein interactions: yeast two-hybrid
10. Protein-protein interactions: proximity labelling, BiFC, others
11. Protein tags: types and applications
12. SELEX and phage display
13. Site-directed and random mutagenesis
14. RNA interference, siRNA, microRNA

Praktikum:

Ein zweiwöchiges Blockpraktikum bietet die Möglichkeit in der VL vorgestellte Methoden und Techniken im Labor durchzuführen.

Übung:

Fakultative Übung zur VL Funktionelle Genomik

Inhalte:

• Wie plant man Klonierungen basierend auf Restriktionsenzymverdau und Ligation?
• Wie designt man Primer für eine PCR?
• Wie plant man Multi-Gen Assemblierungsprojekte basierend auf Gibson Assembly und Golden Gate Klonierung (Typ II S Restriktionsenzymen)?
• Wie designt man eine Genomeditierung mittels CRISPR Cas9 (Design und Klonierung der sgRNA, Design und Klonierung von Donorfragmenten)?