Das hier aufgeführte Modul basiert auf in den Amtlichen Bekanntmachungen der Universität Potsdam veröffentlichten Studien- und Prüfungsordnungen.
Verbindliche Regelungswirkung haben nur die veröffentlichten Ordnungen.
| BIO-MBIP04: Analysis of Cellular Networks | Anzahl der Leistungspunkte (LP): 6 LP |
| Modulart (Pflicht- oder Wahlpflichtmodul): | Abhängig vom Studiengang (siehe unten) |
| Inhalte und Qualifikationsziele des Moduls: | Inhalt Das Modul befasst sich mit graphentheoretischen Ansätzen zur Analyse großer Mengen biologischer Daten. Der Schwerpunkt liegt auf netzwerkwissenschaftlichen Algorithmen für die Analyse, den Vergleich und die Charakterisierung von genregulatorischen Pfaden, Protein-Protein-Interaktionen und metabolischen Netzwerken. Techniken zur Integration von Transkriptom-, Proteom- und Metabolomdaten mit zellulären Netzwerken werden ebenfalls diskutiert. Graphentheoretische Methoden zum Clustering, zum Vergleich und zur Motivsuche in biologischen Netzwerken werden behandelt und zur Beantwortung systembiologischer Fragestellungen, die für biotechnologische und medizinische Anwendungen relevant sind, eingesetzt. Darüber hinaus werden Verbindungen zum maschinellen Lernen mit Netzwerken hervorgehoben.
Qualifikationsziele
Die Studierenden beherrschen die Grundlagen der Analyse von Hochdurchsatzdaten mit Methodiken von Netzwerk-Verfahren.
Die Studierenden sind zur Anwendung von fortgeschrittenen Clusterverfahren, der Generation von Netzwerk-Modellen aus Hochdurchsatzdaten und zur topologischen und statistischen Analyse von Netzwerken befähigt.
Fähigkeit zur Anwendung der erlernten Methoden auf experimentelle Daten. |
| Modul(teil)prüfung (Anzahl, Form, Umfang, Arbeitsaufwand in LP): |
Klausur, 90 Minuten, bestehend aus theoretischem und praktischem Anteil |
| Selbstlernzeit (in Zeitstunden (h)): | 120 |
| Veranstaltungen (Lehrformen) |
Kontaktzeit (in SWS) |
Prüfungsnebenleistungen (Anzahl, Form, Umfang) |
Lehrveranstaltungsbegleitende Modul(teil)prüfung
(Anzahl, Form, Umfang) |
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| Für den Abschluss des Moduls | Für die Zulassung zur Modulprüfung | |||
| Vorlesung (Vorlesung) | 2 | - | Quiz (50%) |
- |
| Übung (Übung) | 2 | - | Übungsaufgaben (50%) |
- |
| Häufigkeit des Angebots: | SoSe |
| Voraussetzung für die Teilnahme am Modul: | Empfohlen: BIO-MBIB01, BIO-B-KM1 |
| Anbietende Lehreinheit(en): |
Biologie/Biochemie
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| Zuordnung zu Studiengängen | Modulart |
|---|---|
| Master of Science Bioinformatics WiSe 2018/19 |
Pflichtmodul
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| Master of Science Computational Science WiSe 2019/20 |
Wahlpflichtmodul
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| Master of Science Ecology, Evolution and Conservation WiSe 2019/20 |
Wahlpflichtmodul
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| Master of Science Mathematics WiSe 2019/20 |
Wahlpflichtmodul
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