Das hier aufgeführte Modul basiert auf in den Amtlichen Bekanntmachungen der Universität Potsdam veröffentlichten Studien- und Prüfungsordnungen.
Verbindliche Regelungswirkung haben nur die veröffentlichten Ordnungen.
BIO-MBIW02: Advanced methods for Analysis of Biochemical networks | Anzahl der Leistungspunkte (LP): 6 LP |
Modulart (Pflicht- oder Wahlpflichtmodul): | Abhängig vom Studiengang (siehe unten) |
Inhalte und Qualifikationsziele des Moduls: | Inhalt Themen der chemischen Reaktions-Netzwerk-Theorie (CRNT) werden behandelt und an realen Beispielen illustriert. Die Themen fokussieren auf Zustände stabiler Konzentrationen (steady-state) in Netzwerken untersetzt mit verschiedenen Kinetik-Typen (Bsp.: “mass action”, “power law”) und schließen Untersuchungen zur Existenz positiver steady-state Konzentrationen, multipler stabiler Zustände, Netzwerkstabilität , Robustheit und Plastizität von Konzentrationen bei sich verändernden Umgebungen ein. Zusammenhänge von dynamischen Eigenschaften mit bei Anwesenheit von bestimmten Unternetzwerken werden vorgestellt. Die Themen sollen der Verdeutlichung von strukturellen Eigenschaften in Bezug auf dynamisches Verhalten und deren Verwendbarkeit in Studien der synthetischen Biologie dienen.
Qualifikationsziele
Tieferes Verständnis der mathematischen und theoretischen Grundlagen chemischer Reaktionsnetzwerke und die Eigenschaften ihrer Dynamik.
Erlernen mathematischer Methoden um Beziehungen zwischen Netzwerkstruktur, Phänotypen und biologischen Funktionen herzustellen
Stärkung der Fähigkeiten in MATLAB und verschiedener anderer Software-Lösungen um Probleme der synthetischen Biologie anzugehen. |
Modul(teil)prüfung (Anzahl, Form, Umfang, Arbeitsaufwand in LP): |
Mündliche Prüfung, 20 Minuten |
Selbstlernzeit (in Zeitstunden (h)): | 120 |
Veranstaltungen (Lehrformen) |
Kontaktzeit (in SWS) |
Prüfungsnebenleistungen (Anzahl, Form, Umfang) |
Lehrveranstaltungsbegleitende Modul(teil)prüfung
(Anzahl, Form, Umfang) |
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Für den Abschluss des Moduls | Für die Zulassung zur Modulprüfung | |||
Vorlesung und Übung (Vorlesung und Übung) | 2V + 2Ü | - | Übungsaufgaben (50%) und Quiz (50%) |
- |
Häufigkeit des Angebots: | WiSe |
Voraussetzung für die Teilnahme am Modul: | keine |
Anbietende Lehreinheit(en): |
Biologie/Biochemie
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Zuordnung zu Studiengängen | Modulart |
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Master of Science Bioinformatics WiSe 2018/19 |
Wahlpflichtmodul
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Master of Science Ecology, Evolution and Conservation WiSe 2019/20 |
Wahlpflichtmodul
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Master of Science Mathematics WiSe 2019/20 |
Wahlpflichtmodul
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