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Foto: Matthias Friel

Modul: Advanced methods for Analysis of Biochemical networks


Das hier aufgeführte Modul basiert auf in den Amtlichen Bekanntmachungen der Universität Potsdam veröffentlichten Studien- und Prüfungsordnungen.
Verbindliche Regelungswirkung haben nur die veröffentlichten Ordnungen.


BIO-MBIW02: Advanced methods for Analysis of Biochemical networks Anzahl der Leistungspunkte (LP):
6 LP
Modulart (Pflicht- oder Wahlpflichtmodul): Abhängig vom Studiengang (siehe unten)
Inhalte und Qualifikationsziele des Moduls:

Inhalt

Themen der chemischen Reaktions-Netzwerk-Theorie (CRNT) werden behandelt und an realen Beispielen illustriert. Die Themen fokussieren auf Zustände stabiler Konzentrationen (steady-state) in Netzwerken untersetzt mit verschiedenen Kinetik-Typen (Bsp.: “mass action”, “power law”) und schließen Untersuchungen zur Existenz positiver steady-state Konzentrationen, multipler stabiler Zustände, Netzwerkstabilität , Robustheit und Plastizität von Konzentrationen bei sich verändernden Umgebungen ein. Zusammenhänge von dynamischen Eigenschaften mit bei Anwesenheit von bestimmten Unternetzwerken werden vorgestellt. Die Themen sollen der Verdeutlichung von strukturellen Eigenschaften in Bezug auf dynamisches Verhalten und deren Verwendbarkeit in Studien der synthetischen Biologie dienen.

 

Qualifikationsziele

  • Berufliche Kompetenzen

Tieferes Verständnis der mathematischen und theoretischen Grundlagen chemischer Reaktionsnetzwerke und die Eigenschaften ihrer Dynamik.

  • Methodische Kompetenzen

Erlernen mathematischer Methoden um Beziehungen zwischen Netzwerkstruktur, Phänotypen und biologischen Funktionen herzustellen

  • Praktische Kompetenzen

Stärkung der Fähigkeiten in MATLAB und verschiedener anderer Software-Lösungen um Probleme der synthetischen Biologie anzugehen.

Modul(teil)prüfung (Anzahl, Form, Umfang, Arbeitsaufwand in LP):

Mündliche Prüfung, 20 Minuten

Selbstlernzeit (in Zeitstunden (h)): 120

Veranstaltungen
(Lehrformen)
Kontaktzeit
(in SWS)
Prüfungsnebenleistungen
(Anzahl, Form, Umfang)
Lehrveranstaltungsbegleitende Modul(teil)prüfung
(Anzahl, Form, Umfang)
Für den Abschluss des Moduls Für die Zulassung zur Modulprüfung
Vorlesung und Übung (Vorlesung und Übung) 2V + 2Ü -

Übungsaufgaben (50%) und Quiz (50%)

-

Häufigkeit des Angebots:

WiSe

Voraussetzung für die Teilnahme am Modul: keine
Anbietende Lehreinheit(en): Biologie/Biochemie
Zuordnung zu Studiengängen Modulart
Master of Science Bioinformatics WiSe 2018/19 Wahlpflichtmodul
Master of Science Ecology, Evolution and Conservation WiSe 2019/20 Wahlpflichtmodul
Master of Science Mathematics WiSe 2019/20 Wahlpflichtmodul