Das hier aufgeführte Modul basiert auf in den Amtlichen Bekanntmachungen der Universität Potsdam veröffentlichten Studien- und Prüfungsordnungen.
Verbindliche Regelungswirkung haben nur die veröffentlichten Ordnungen.
MAT-MBIP05: Introduction to Theoretical Systems Biology | Anzahl der Leistungspunkte (LP): 6 LP |
Modulart (Pflicht- oder Wahlpflichtmodul): | Abhängig vom Studiengang (siehe unten) |
Inhalte und Qualifikationsziele des Moduls: | Inhalt Der Kurs führt in die kinetische Modellierung basierend auf stochastischen und deterministischen Formulierungen biochemischer Reaktionen von ausgewählten biologischen Systemen ein. Mathematische Modelle für das Modellieren von Signalwegen, von gene-regulatorischen und metabolischen Netzwerken werden präsentiert und kritisch evaluiert. Verschiedene Modellreduktionsverfahren werden behandelt. Grundlagen für das Lösen von gewöhnlichen Differentialgleichungen (ODE) werden ebenfalls vorgestellt. Computer-Implementierungen der behandelten Themen werden in den Übungen* demonstriert.
Qualifikationsziele
Die Studierenden können mathematische Formulierungen systembiologischer Fragestellungen vorstellen und sind befähigt, Modelle biologischer Systeme kritisch zu analysieren.
Beherrschen der Grundlagen des stochastischen und deterministischen Modellierens. Die Studierenden haben Kenntnis von theoretischen und numerischen Methoden zur Analyse von Differenzialgleichungen.
Die Studierenden sammeln Erfahrungen in der Analyse von Differenzialgleichungs-Systemen für kleinere Systeme. |
Modul(teil)prüfungen (Anzahl, Form, Umfang, Arbeitsaufwand in LP): | Eine Prüfung der folgenden Formen: Klausur, 90 Minuten Mündliche Prüfung, 30 Minuten |
Selbstlernzeit (in Zeitstunden (h)): | 120 |
Veranstaltungen (Lehrformen) |
Kontaktzeit (in SWS) |
Prüfungsnebenleistungen (Anzahl, Form, Umfang) |
Lehrveranstaltungsbegleitende Modul(teil)prüfung
(Anzahl, Form, Umfang) |
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Für den Abschluss des Moduls | Für die Zulassung zur Modulprüfung | |||
Vorlesung und Übung (Vorlesung und Übung) | 2V + 2Ü | - | Übungsaufgaben (50%) |
- |
Häufigkeit des Angebots: | SoSe |
Voraussetzung für die Teilnahme am Modul: | Empfohlen: BIO-MBIP01 oder BIO-MBIP02
Für Master of Science Computational Science vom WiSe 2019/20 gilt abweichend folgendes: Empfohlen sind Kenntnisse auf dem Gebiet der algorithmischen, mathematischen und statistischen Informatik |
Anbietende Lehreinheit(en): |
Mathematik
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Zuordnung zu Studiengängen | Modulart |
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Master of Science Bioinformatics WiSe 2018/19 |
Pflichtmodul
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Master of Science Computational Science WiSe 2019/20 |
Wahlpflichtmodul
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Master of Science Ecology, Evolution and Conservation WiSe 2019/20 |
Wahlpflichtmodul
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Master of Science Mathematics WiSe 2019/20 |
Wahlpflichtmodul
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Master of Science Mathematik WiSe 2015/16 |
Wahlpflichtmodul
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Fakultätskatalog Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät WiSe 2016/17 |
Abhängig vom Studiengang
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