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Foto: Matthias Friel

Analysis of high-throughput sequencing data - Einzelansicht

  • Funktionen:
  • Zur Zeit keine Belegung möglich
Veranstaltungsart Blockveranstaltung Veranstaltungsnummer
SWS 4 Semester WiSe 2021/22
Einrichtung Institut für Biochemie und Biologie   Sprache englisch
Belegungsfrist 01.10.2021 - 10.11.2021   
Gruppe 1:
     Zur Zeit keine Belegung möglich
    Tag Zeit Rhythmus Dauer Raum Lehrperson fällt aus am Max. Teilnehmer/-innen
Blockveranstaltung -  bis  Block am   Dr. Kappel  
Bemerkung

This is a block couse mixing lectures and hands-on work (exercises). It will take place from 28 Februrary to 11 March 2022, 9 am to 5 pm. Online via Zoom, maybe also somewhere in Potsdam Golm, if possible (hybrid course then).

 

There will be three information/discussion meetings via Zoom (Meeting ID: 686 6154 6081, Passcode: 06444769), feel free to join them.

  • 8 October 2021, 11 to 12 am
  • 25 October 2021, 5 to 6 pm
  • 2 November 2021, 12 to 12:45 am

Those meetings are not mandatory, you may join any time. If you cannot make it and would like to have another one, please contacte the lecturer (see below).

 

You will need to have access to a simple PC for the time of the course. The only thing you need is a Web Browser and a Linux Terminal. In Windows you may use tools like Putty (https://www.putty.org/) or MobaXTerm (https://mobaxterm.mobatek.net/download.html, Home Edition). Some basic knowledge about the Linux Terminal may be helpful also, you can find a good starter here: http://swcarpentry.github.io/shell-novice/.

 

You should have some knowledge about biology to get most out of this course. Also attending the Evolutionary Genomics course taught by Stefanie Hartmann may be a very good option in every case.

 

You may find a rough description of the course in the Bioinformatics module guide, BIO-MBIW08 (https://www.uni-potsdam.de/fileadmin01/projects/mnfakul/Dokumente_und_%C3%9Cbersichten/Studium_und_Lehre/Module_Guide_Bioinformatics_EN.pdf).

 

There is a Moodle page for this course: HTS2022, https://moodle2.uni-potsdam.de/course/view.php?id=31580.

 

Please contact christian.kappel@uni-potsdam.de for any question or if you need some special arrangements.


Strukturbaum
Die Veranstaltung wurde 17 mal im Vorlesungsverzeichnis WiSe 2021/22 gefunden:
Vorlesungsverzeichnis
Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät
Institut für Informatik und Computational Science
Master of Science
Computational Science (Prüfungsversion ab WiSe 2013/14)
XI. Vertiefungsmodule Naturwissenschaften
Bereich Bioinformatik
Practical sequence analysis  - - - 1
IX. Wahlpflichtmodul
Practical sequence analysis  - - - 2
Data Science (Prüfungsversion ab WiSe 2018/19)
Compulsory Modules
INF-DS-C4 - Applied Data Science  - - - 3
Computational Science (Prüfungsversion ab WiSe 2019/20)
V. Vertiefungsmodule Naturwissenschaften
Bereich Bioinformatik
BIO-MBIW08 - Practical sequence analysis  - - - 4
Institut für Biochemie und Biologie
Master of Science
Ecology, Evolution and Conservation (Prüfungsversion ab WiSe 2019/20)
Elective modules B
BIO-B-WM10 - Genome Research and Systems Biology B  - - - 5
BIO-B-WM11 - Molecular Biology B  - - - 6
Elective modules A
BIO-O-WM5 - Data acquisition and analysis  - - - 7
BIO-O-WM17 - Interactions ecology, evolution, and genetics  - - - 8
Bioinformatik (Prüfungsversion ab WiSe 2010/11)
Wahlpflichtmodule
Ausgewählte Methoden und Techniken der Systembiologie und Informatik  - - - 9
Modellorganismen und Methoden der Genomforschung  - - - 10
Fakultative Lehrveranstaltungen  - - - 11
Biochemistry and Molecular Biology (Prüfungsversion ab WiSe 2016/17)
Richtungsmodule
BIO-B-RM3 - Evolutionary Genomics (Evolution across Scales module D)  - - - 12
Wahlpflichtmodule
BIO-B-WM10 - Genome Research and Systems Biology B  - - - 13
BIO-B-WM11 - Molecular Biology B  - - - 14
BIO-B-WM12 - Cellular and Development Biology B  - - - 15
Ökologie/Evolution/Naturschutz (Prüfungsversion ab WiSe 2010/11)
Fakultative Lehrveranstaltungen  - - - 16
Bioinformatics (Prüfungsversion ab WiSe 2018/19)
Elective Modules
BIO-MBIW08 - Practical sequence analysis  - - - 17